В 2025 году качество воды в большинстве створов Братского водохранилища немного ухудшилось, но продолжает оставаться в основном условно чистым. Согласно отчёту Росгидромета, в 62% створах вода считается «условно чистой», в 31% — «слабо загрязнённой», и в 7% — «загрязнённой». В сравнении с 2024 годом показатели немного ухудшились.
В Усть-Илимском водохранилище ситуация чуть более сложная — почти не изменилась по сравнению с прошлым годом, и качество воды там считается более загрязнённым: 38% створов — «условно чистые», ещё 38% — «слабо загрязнённые», и 24% — «загрязнённые». Основные загрязнители — соединения меди, марганца и органические вещества.